生物芯片北京国家工程研究中心经国家发改委批准成立，是依托于腾博会生物的中国生物芯片领域规模与研发实力雄厚的国家级研究机构。鉴于中心良好的示范效果和各地生物芯片产业发展的实际需求，2007年以来，生物芯片北京国家工程研究中心分别在新疆、山西、宁波、宁夏、烟台、北京、上海、甘肃等地区成立了分中心，其中新疆、山西、宁波和宁夏4家于2012年已经获得国家发改委办公厅批复和授牌。
各分中心针对所在区域发展需求，充分利用自身专业和技术队伍的特色优势，积聚整合资源加速生物芯片技术的研究、应用及产业化，为促进地方经济和生物技术产业的发展提供技术支撑，在构建区域创新体系、提高自主创新能力中发挥了独特的作用。
宁夏分中心
依托宁夏医科大学总医院，以宁夏生命科学研究、健康评价与临床诊断等应用领域发展为基础，将转化医学、动物疫病防治、特色植物资源开发利用作为三大科研主题，建设立足宁夏、辐射陕甘蒙等周边地区的生物芯片技术研究的特色平台，围绕地方病研究、动植物疫病防治和特色动植物开发利用等，提供生物芯片研发和检测分析等科技服务。
新疆分中心
生物芯片北京国家工程研究中心新疆分中心是国家发展改革委员会在省、自治区设立的首批分中心之一，依托新疆医科大学第一附属医院，针对新疆高发病的基础研究和转化应用、新疆民族医药资源的研发和药物筛选，研发可用于创新研究和转化成为早筛早诊的生物芯片等系列产品。同时以科研项目促医药学高质量发展，面向全疆开展人才培养，技术研发和推广应用。
甘肃分中心
依托甘肃省肿瘤医院，以临床基因扩增检验技术为基础，积极探索生物芯片技术在肿瘤疾病中的研发与应用。利用ABI-3500DX基因测序仪，ABI9700基因扩增仪，ABI7500荧光定量基因扩增仪，ABI7300Plus荧光定量基因扩增仪，宏石SLAN-96S荧光定量基因扩增仪，DA7600荧光定量基因扩增仪，恒温微流控芯片核酸分析仪，全自动核酸提取仪，全自动核酸分子杂交仪，生物芯片杂交仪，生物芯片点样仪等六十余台（套）先进仪器，开展包括遗传学检测、病原学检测、肿瘤基因检测和药物基因多态性检测。分中心建设的PCR实验室通过了甘肃省临床检验中心专家组的验收考核，取得临床基因扩增实验室技术验收合格证书，符合开展各类临床基因扩增检验项目的条件和要求。
宁波分中心
依托宁波大学，创建我国首个海洋生物芯片技术平台，推动高新技术在海洋产业中的研究与应用。通过生物芯片技术在海洋领域的原始创新、集成创新及应用，重点针对我国沿海的环境问题和生态安全问题，挖掘沿海生物的优良基因，阐明海洋生物资源开发与利用机制，建立有害生物的快速检测与应对方案，为我国海洋生物技术产业创新搭建起新型技术平台和技术体系。
上海分中心
依托于上海交通大学医学院附属第六人民医院及上海市糖尿病研究所。分中心可开展遗传、肿瘤、感染、药物基因组学等二十余项检测。在代谢性疾病领域，开发相关可用于研究和应用的生物芯片，探索新型预警监控手段和代谢性疾病健康管理追踪系统。充分发挥创新平台对研发试验活动，工程技术验证和人才培养方面的支撑作用，推动有关研究成果加快实现产业转化。建成立足上海，辐射长三角及周边地区的代谢性疾病生物芯片研究中心。
阳江分中心
依托于广东医科大学附属阳江市人民医院精准医学中心，辐射珠三角及粤西地区，打造高水平临床科研实验室，针对华南地区的高发遗传病如地中海贫血等开展研究，以临床基因扩增检验技术为基础，应用生物芯片技术开展肿瘤和遗传疾病的检测服务。针对阳江地区天然高本底辐射的特点及阳江核电站周围生态，开展辐射对健康人群影响的研究。我中心利用ABI-3500DX基因测序仪、Bioeletroc Seq 4000基因测序仪、ABI7500荧光定量PCR仪、恒温微流控芯片核酸分析仪、微阵列芯片扫描仪、生物芯片分析仪等二十余台先进仪器，开
展包括病原体、遗传、药物代谢和肿瘤基因检测等一系列临床服务。我中心的PCR实验室通过了广东临检中心专家组的验收考核，取得临床基因扩增实验室技术验收合格证书，符合开展各类临床基因扩增检验项目的条件和要求。
烟台分中心
依托烟台毓璜顶医院，以“精准医学大数据平台建设”为基础，积极推动基础研究与临床医学的有机结合，发挥省级区域医疗中心和医联体模式，坚持以群众需求和公共预防为导向，整合优势资源，充分利用二代测序和芯片平台，围绕肿瘤、遗传等领域，不断开拓具有临床应用潜力的新产品、新技术，致力于建设资源共享的区域性生物芯片研发和检测服务中心。
